Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Mre11Q61216 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mre11Q61216 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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