Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbbp4Q60972 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms