Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm22906-201ENSMUST00000175191 250 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mkrn3Q60764 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms