Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Csnk2a1Q60737 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms