Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
C2cd3Q52KB6 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms