Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc27Q3V036 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc27Q3V036 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms