Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms