Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gtpbp6Q3U6U5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gtpbp6Q3U6U5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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