Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms