Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRR0

Map9, Microtubule-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map9Q3TRR0 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Map9Q3TRR0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Map9Q3TRR0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms