Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Usp39Q3TIX9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms