Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms