Protein–RNA interactions for Protein: Q3L180

Defa26, Alpha-defensin 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa26Q3L180 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Defa26Q3L180 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms