Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trim71Q1PSW8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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