Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rundc1Q0VDN7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms