Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ttc21bQ0HA38 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ttc21bQ0HA38 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Ttc21bQ0HA38 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc21bQ0HA38 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms