Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MitfQ08874 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MitfQ08874 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms