Protein–RNA interactions for Protein: Q03157

Aplp1, Amyloid-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp1Q03157 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Aplp1Q03157 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Aplp1Q03157 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms