Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rad50P70388 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms