Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dpf3P58269 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms