Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rpl5P47962 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl5P47962 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms