Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nedd4P46935 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nedd4P46935 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms