Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tnfsf9P41274 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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