Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DesP31001 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DesP31001 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DesP31001 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DesP31001 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DesP31001 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DesP31001 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms