Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpl3P27659 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rpl3P27659 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl3P27659 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms