Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd12P23812 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms