Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PrkcaP20444 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms