Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Pou4f1P17208 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pou4f1P17208 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pou4f1P17208 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms