Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
Vpreb2P13373 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms