Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cfdp1O88271 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms