Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Sdc4O35988 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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