Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms