Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Gm34099-201ENSMUST00000211592 704 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Mgat4d-201ENSMUST00000038692 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lhx8O35652 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm11871-201ENSMUST00000122429 1061 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm35202-201ENSMUST00000130083 712 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 1700019E08Rik-201ENSMUST00000134308 424 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lhx8O35652 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms