Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp35M0QWN7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Usp35M0QWN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Usp35M0QWN7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp35M0QWN7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp35M0QWN7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Usp35M0QWN7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp35M0QWN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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