Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Tmem200cJ3QK46 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem200cJ3QK46 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms