Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ScaperF8VQ70 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms