Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Colca2F8VPY8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.7 ms