Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm8005F6YKY3 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms