Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Col22a1E9Q7P1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms