Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms