Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms