Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cspp1B2RX88 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cspp1B2RX88 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms