Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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PtprbB2RU80 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PtprbB2RU80 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprbB2RU80 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprbB2RU80 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprbB2RU80 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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PtprbB2RU80 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PtprbB2RU80 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms