Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Prrt4B2RU40 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms