Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trabd2bB1ATG9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Trabd2bB1ATG9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Trabd2bB1ATG9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trabd2bB1ATG9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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