Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
H2-M5A7VMS3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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