Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H2al1jA2BFR3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
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H2al1jA2BFR3 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H2al1jA2BFR3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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