Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn6A2AJB9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Lcn6A2AJB9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Lcn6A2AJB9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Lcn6A2AJB9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Lcn6A2AJB9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Lcn6A2AJB9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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