Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms