Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
A0A0U1RNP2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms